茎腐病:炎热夏季,过高的土温常烫伤银杏苗幼嫩茎基部的表皮,真菌便乘机侵入伤口。发病茎部首先变褐,皮层皱缩,内皮腐烂。病菌继续侵入木质部和髓部,使髓部变暗褐色,中间逐渐空茎,并产生黑色小菌核,随后病菌侵入根部,皮层腐烂。上部植株枯死,拔起苗木,根皮脱落,仅剩下木质部。一般情况下,在入梅早、且梅雨季节持续时间短的情况下,发病早而严重,造成死苗,严重时死苗率达90%以上。
叶枯病:发病初期叶片先端变黄,以后黄色部位逐渐变褐坏死,并扩展到整个叶缘,其后病斑向叶片基部蔓延,直至整张叶片变褐并枯焦脱落。一般从5月至6月开始发生,7月至8月为发病高峰。随着时间的推移,病株的感病枝条会越来越长,褐色枝叶越来越多,严重时整株树叶全部脱落,树冠光秃,甚至一些嫩枝也枯干而死。
枯梢病:该病为真菌性病害,一般在当年新梢长度达5厘米左右时开始出现。刚开始时新梢顶端幼叶上可见紫红色病斑,随后蔓延到生长点。约经20天病部颜色由紫红色变为褐色,直至坏死干枯,干枯的幼叶不掉落。生长点坏死再经20天至30天,坏死梢下部腋芽萌发成侧枝或主梢,抽发的新梢长5厘米左右时,顶部幼叶再次被侵染发病。少数病株能三次抽发新梢,但同样被再次侵染。反复感病后,病株上部枝梢丛呈扫帚状,生长被抑制。